A la maison, on le chasse le plus vite possible. Mais ce que nous considérons généralement comme un déchet aide les scientifiques à comprendre comment la colonie de microbes appelée votre microbiome intestinal est pertinente pour la santé de votre peau et le cancer de la peau.
Parfois, les plus petites choses ont le plus grand effet (surtout quand il s'agit de science). Au cours des deux dernières décennies, les chercheurs ont étudié le microbiome intestinal - la communauté d'êtres vivants microscopiques qui ont élu domicile dans vos intestins. Et il s'avère que ces minuscules organismes peuvent avoir un impact sur presque tous les aspects de la santé humaine.
En comparant le microbiote intestinal de patients atteints d'une maladie à celui de patients non atteints, les scientifiques ont souvent constaté qu'une différence dans l'abondance relative de certaines espèces microbiennes était associée à la présence ou à l'absence de la maladie. Plus récemment, des chercheurs ont découvert que le microbiote intestinal des patients atteints de mélanome ne répondant pas aux immunothérapies diffère de celui des patients y répondant.
Mais comment les scientifiques déterminent-ils ce qu'il y a dans votre microbiome intestinal ? Ce serait difficile à faire s'il n'y avait pas les déchets que votre corps élimine (avant qu'il ne soit rincé) : oui, la preuve est dans le caca - bien que « selles » soit le terme médical préféré. À l'aide d'échantillons de selles, les scientifiques peuvent analyser les principales différences entre les microbiomes intestinaux des individus. (Si vous vous demandez comment les échantillons de selles sont collectés, voir « Un meilleur système de collecte de caca » ci-dessous.)
Si le microbiome survit dans nos selles et diffère entre les personnes en bonne santé et celles atteintes d'une maladie, les selles d'une personne en bonne santé pourraient-elles être utilisées pour soigner une personne malade ? Eh bien, oui. ( Beurk ! ) Les traitements modifiant le microbiome intestinal remontent au IVe siècle en Chine, avec une préparation – peu appétissante – appelée « soupe jaune ». Aujourd'hui, ces méthodes ont été standardisées et regroupées sous le terme de transplantation de microbiote fécal (TMF).
Cette procédure est essentiellement l'équivalent microbien d'une transfusion sanguine. Un échantillon de selles d'un donneur sain, contenant des éléments de son microbiote intestinal, est transplanté chez un patient, généralement par coloscopie. N'essayez pas cela à la maison, cependant, car l'échantillon est soigneusement traité et vérifié pour tout organisme potentiellement dangereux avant la transplantation.
La FMT a connu son premier succès moderne en traitant des patients atteints d'une infection connue sous le nom de C. diff, du nom de la bactérie qui la cause - Clostridioides difficile. Comme son nom l'indique, C. diff est notoirement difficile à traiter. La bactérie peut être résistante aux antibiotiques et l'infection commence souvent après qu'un patient a suivi un traitement intensif aux antibiotiques pour un problème distinct. Avant l'avènement de la FMT, environ la moitié des patients mourraient d'infections récurrentes à C. difficile dans leur tube digestif. Aujourd'hui, entre 80 et 90 % des patients atteints de C. diff récurrents sont guéris avec un seul traitement FMT. Dans la foulée de ce succès, FMT a montré des résultats prometteurs dans des essais cliniques pour le traitement d'autres troubles gastro-intestinaux, tels que la maladie de Crohn et la colite ulcéreuse, deux types de maladies inflammatoires de l'intestin.
TMF pour le cancer de la peau ?
Des chercheurs testent actuellement la transplantation de microbiote fécal (TMF) chez des patients atteints de mélanome. Cette technique consiste à prélever un échantillon du microbiote de patients ayant répondu à l'immunothérapie et à le transplanter chez des patients non répondeurs. En 2021, deux études ont démontré son efficacité. Dans une étude, six patients sur quinze, et dans l'autre, trois patients sur dix (toutes deux publiées dans la revue Science ), ont présenté une réponse positive au traitement après la TMF. « Il s'agit d'études de phase 1 de petite envergure , mais les résultats sont extrêmement prometteurs », explique Alena Pribyl, docteure en sciences, chercheuse principale et chargée de recherche chez Microba, une entreprise australienne menant des recherches novatrices sur le microbiote.
"C'était une preuve de concept que vous pouviez améliorer la réponse d'un patient aux inhibiteurs du point de contrôle immunitaire en modifiant son microbiome intestinal."
Cela pourrait être extrêmement bénéfique puisque seulement 30 à 40 % des patients répondent actuellement aux immunothérapies.
Bien que ce soit une excellente nouvelle, le Dr Pribyl, qui n'a participé à aucune des deux études, souligne également que la transplantation de microbiote fécal (TMF) reste une méthode rudimentaire. « On se base sur la présence de selles saines chez le donneur, mais c'est une énigme, car nous ignorons encore toutes les bactéries présentes dans cet échantillon et leur rôle », explique-t-elle. Des laboratoires du monde entier, dont Microba, s'efforcent de percer ce mystère et ont commencé à identifier certaines espèces candidates grâce à des études observationnelles et des essais cliniques, même si des recherches supplémentaires sont nécessaires. Une fois les espèces clés responsables de l'amélioration de la réponse à l'immunothérapie identifiées, des thérapies plus sûres, utilisant uniquement des formes purifiées de ces espèces, pourront être développées. À terme, ces recherches, parmi d'autres, pourraient permettre à l'immunothérapie d'aider davantage de patients et de sauver plus de vies. ( Pour plus d'informations sur les études portant sur le microbiote intestinal, consultez clinicaltrials.gov .)
Pour en savoir plus sur l'avenir de la recherche sur le microbiome et sur ce que nous pouvons faire dès maintenant pour notre santé, consultez l'article « L'avenir de la santé de la peau se trouve peut-être en vous ». Si vous souhaitez en savoir plus sur les bases du microbiome, consultez l'article « Quel est le lien entre la santé intestinale et la santé de la peau ? ». Saviez-vous qu'il existe aussi un microbiome cutané ?
Un meilleur système de collecte de caca
Vous vous demandez sans doute comment les chercheurs obtiennent les échantillons de selles dont ils ont besoin. Disons simplement que les méthodes de transport se sont nettement améliorées. Le prélèvement d'échantillons de selles à domicile se fait généralement à l'aide d'un seau ou d'une bassine en plastique peu profonde, d'une cuillère et d'un tube à essai. L'une des nouvelles technologies utilisées par Microba s'appelle le FLOQSwab. De la taille et de la forme d'un applicateur de gloss, il ressemble beaucoup aux écouvillons utilisés pour les tests de dépistage de la COVID-19. Pour prélever un échantillon destiné à l'analyse du microbiome, il suffit de frotter l'écouvillon sur un morceau de papier toilette usagé, puis de l'insérer dans le tube. C'est tout. « Le tube contient du gel de silice pour sécher l'échantillon, ce qui contribue à préserver l'ADN », explique le Dr Pribyl. En 2021, elle et ses collègues ont publié un article dans la revue Nature démontrant que le FLOQSwab préservait la communauté microbienne avec une plus grande précision que les autres méthodes. Le gel de silice absorbe l'humidité de l'air (c'est ce qui remplit les sachets portant la mention « ne pas ingérer » que l'on trouve dans de nombreux produits), et un échantillon mieux conservé permet à Microba de dresser un tableau plus complet de ce qui vit dans votre microbiome intestinal.
